2月19日，記者從中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院蔬菜花卉研究所獲悉，該所蔬菜分子設(shè)計(jì)育種創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)和甘藍(lán)類蔬菜遺傳育種創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)，聯(lián)合荷蘭瓦赫寧根大學(xué)植物育種系生長(zhǎng)與發(fā)育團(tuán)隊(duì)，構(gòu)建了高質(zhì)量的甘藍(lán)泛基因組和圖形基因組，揭示了結(jié)構(gòu)變異驅(qū)動(dòng)甘藍(lán)形態(tài)類型多樣化的快速馴化。相關(guān)成果日前發(fā)表在國(guó)際期刊《自然·遺傳學(xué)》上。
中國(guó)科學(xué)院院士錢(qián)前認(rèn)為，這項(xiàng)研究通過(guò)泛基因組和大規(guī)模多組學(xué)數(shù)據(jù)分析，揭示了甘藍(lán)類蔬菜作物如何在較短時(shí)間內(nèi)馴化出多樣的變種類型，以及結(jié)構(gòu)變異調(diào)控基因表達(dá)是甘藍(lán)多樣性進(jìn)化的“分子加速器”這一重要規(guī)律。
該研究首先基于700余份甘藍(lán)野生種和覆蓋所有變種材料的重測(cè)序數(shù)據(jù)構(gòu)建了系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)，發(fā)現(xiàn)甘藍(lán)變種主要起源于兩個(gè)獨(dú)立的馴化事件。研究團(tuán)隊(duì)據(jù)此選取了22個(gè)具有代表性的野生甘藍(lán)和變種材料，利用測(cè)序技術(shù)構(gòu)建了染色體水平的高質(zhì)量基因組。“與已有的甘藍(lán)基因組相比，此次新構(gòu)建的基因組在序列連續(xù)性、著絲粒完整性等方面都有顯著提升。此外，研究進(jìn)一步構(gòu)建了甘藍(lán)的圖形基因組，并從中挖掘到一批在不同變種中受到特異性馴化選擇的結(jié)構(gòu)變異及相關(guān)基因。這有助于我們更好地理解甘藍(lán)的馴化歷史和變種形成的機(jī)制。”論文共同通訊作者、中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院蔬菜花卉研究所研究員程鋒說(shuō)。
中國(guó)科學(xué)院院士、中國(guó)熱帶農(nóng)業(yè)科學(xué)院院長(zhǎng)黃三文認(rèn)為，這篇論文是十字花科作物馴化研究的重大成果，揭示了甘藍(lán)變種的重要馴化機(jī)制。這項(xiàng)研究同時(shí)也構(gòu)建了迄今為止規(guī)模最大、質(zhì)量最高的甘藍(lán)泛基因組。
2月19日，記者從中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院蔬菜花卉研究所獲悉，該所蔬菜分子設(shè)計(jì)育種創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)和甘藍(lán)類蔬菜遺傳育種創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)，聯(lián)合荷蘭瓦赫寧根大學(xué)植物育種系生長(zhǎng)與發(fā)育團(tuán)隊(duì)，構(gòu)建了高質(zhì)量的甘藍(lán)泛基因組和圖形基因組，揭示了結(jié)構(gòu)變異驅(qū)動(dòng)甘藍(lán)形態(tài)類型多樣化的快速馴化。相關(guān)成果日前發(fā)表在國(guó)際期刊《自然·遺傳學(xué)》上。
中國(guó)科學(xué)院院士錢(qián)前認(rèn)為，這項(xiàng)研究通過(guò)泛基因組和大規(guī)模多組學(xué)數(shù)據(jù)分析，揭示了甘藍(lán)類蔬菜作物如何在較短時(shí)間內(nèi)馴化出多樣的變種類型，以及結(jié)構(gòu)變異調(diào)控基因表達(dá)是甘藍(lán)多樣性進(jìn)化的“分子加速器”這一重要規(guī)律。
該研究首先基于700余份甘藍(lán)野生種和覆蓋所有變種材料的重測(cè)序數(shù)據(jù)構(gòu)建了系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)，發(fā)現(xiàn)甘藍(lán)變種主要起源于兩個(gè)獨(dú)立的馴化事件。研究團(tuán)隊(duì)據(jù)此選取了22個(gè)具有代表性的野生甘藍(lán)和變種材料，利用測(cè)序技術(shù)構(gòu)建了染色體水平的高質(zhì)量基因組。“與已有的甘藍(lán)基因組相比，此次新構(gòu)建的基因組在序列連續(xù)性、著絲粒完整性等方面都有顯著提升。此外，研究進(jìn)一步構(gòu)建了甘藍(lán)的圖形基因組，并從中挖掘到一批在不同變種中受到特異性馴化選擇的結(jié)構(gòu)變異及相關(guān)基因。這有助于我們更好地理解甘藍(lán)的馴化歷史和變種形成的機(jī)制。”論文共同通訊作者、中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院蔬菜花卉研究所研究員程鋒說(shuō)。
中國(guó)科學(xué)院院士、中國(guó)熱帶農(nóng)業(yè)科學(xué)院院長(zhǎng)黃三文認(rèn)為，這篇論文是十字花科作物馴化研究的重大成果，揭示了甘藍(lán)變種的重要馴化機(jī)制。這項(xiàng)研究同時(shí)也構(gòu)建了迄今為止規(guī)模最大、質(zhì)量最高的甘藍(lán)泛基因組。
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