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我國科學家構建出花生全基因組變異圖譜

7個月前 來源:科技日報 觀看:76
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2月27日,記者從廣東省農(nóng)業(yè)科學院獲悉,該院作物研究所花生團隊通過大規(guī)模的花生種質(zhì)資源群體基因組重測序,構建出花生全基因組變異圖譜,并闡明了中國花生的引進與傳播途徑,揭示了花生遺傳改良的分子機制。該研究成果近日在線發(fā)表于《自然·遺傳學》。EWM即熱新聞——關注每天科技社會生活新變化gihot.com

花生是我國重要的油料和經(jīng)濟作物之一。然而,受制于較低的基因組測序研究水平,當前我國對花生基因組水平遺傳變異及關鍵性狀的遺傳基礎仍缺乏系統(tǒng)解析,嚴重制約了花生種質(zhì)的改良及產(chǎn)業(yè)發(fā)展。EWM即熱新聞——關注每天科技社會生活新變化gihot.com

“作物種質(zhì)資源的創(chuàng)新與利用,是當前和未來作物遺傳改良最重要的內(nèi)容。”論文第一作者、廣東省農(nóng)業(yè)科學院作物研究所花生研究室主任魯清說,2019年,研究團隊正式啟動花生大規(guī)模種質(zhì)資源的全基因組重測序項目。EWM即熱新聞——關注每天科技社會生活新變化gihot.com

研究團隊篩選出390份代表性的核心花生種質(zhì),對其進行重測序,構建了一張包含880萬個單核苷酸多態(tài)性的花生全基因組變異圖譜。研究人員對28個重要農(nóng)藝性狀進行了全基因組關聯(lián)分析,獲得了上萬個顯著性關聯(lián)位點。通過候選基因分析,研究人員挖掘到調(diào)控花生株型和含油量的新基因,為分子育種提供優(yōu)異基因資源。EWM即熱新聞——關注每天科技社會生活新變化gihot.com

“含油量相關新基因的挖掘是花生研究的重要方向。找到調(diào)控花生含油量的關鍵基因,就找到了培育高產(chǎn)高油新品種的‘鑰匙’。”魯清介紹,從全基因組層面、從數(shù)百萬個變異位點中進行大規(guī)模樣本的綜合解析,這在該研究領域尚屬首次。EWM即熱新聞——關注每天科技社會生活新變化gihot.com

起源于南美洲的花生是如何引進我國并廣泛傳播的呢?“我們通過系統(tǒng)發(fā)育和種群結構分析,初步證實了我國花生引入后,分別形成了以華北和珠江流域為核心區(qū)域的兩大栽培中心,且兩個主要花生產(chǎn)區(qū)在長期育種過程中頻繁進行基因交換,形成了我國豐富的花生基因資源庫。”研究團隊首席科學家梁炫強介紹,研究表明,我國北方地區(qū)花生類群的基因流主要來自北美,而中國南方的花生則是從南亞和東南亞遷移而來,這也初步印證了多個農(nóng)史資料的結論。EWM即熱新聞——關注每天科技社會生活新變化gihot.com

此外,研究團隊還通過對南方產(chǎn)區(qū)經(jīng)典系譜11個品種測序,鑒定到2064個在育種中保留的核心基因模塊,解析了我國南方花生遺傳改良的分子遺傳機制。EWM即熱新聞——關注每天科技社會生活新變化gihot.com

“該研究提出了深入理解花生遺傳多樣性和傳播演化進程的重要線索,為全球花生的遺傳改良和育種策略的優(yōu)化提供了重要的遺傳資源。”研究團隊學科帶頭人陳小平透露,下一步將開展花生泛基因組研究,挖掘新的基因資源。同時,基于獲得的基因組關鍵結果,開發(fā)花生高效的分子育種技術體系,建立花生基因/基因組設計育種,實現(xiàn)從基因組的理論突破到遺傳育種的實際應用。 EWM即熱新聞——關注每天科技社會生活新變化gihot.com

2月27日,記者從廣東省農(nóng)業(yè)科學院獲悉,該院作物研究所花生團隊通過大規(guī)模的花生種質(zhì)資源群體基因組重測序,構建出花生全基因組變異圖譜,并闡明了中國花生的引進與傳播途徑,揭示了花生遺傳改良的分子機制。該研究成果近日在線發(fā)表于《自然·遺傳學》。EWM即熱新聞——關注每天科技社會生活新變化gihot.com

花生是我國重要的油料和經(jīng)濟作物之一。然而,受制于較低的基因組測序研究水平,當前我國對花生基因組水平遺傳變異及關鍵性狀的遺傳基礎仍缺乏系統(tǒng)解析,嚴重制約了花生種質(zhì)的改良及產(chǎn)業(yè)發(fā)展。EWM即熱新聞——關注每天科技社會生活新變化gihot.com

“作物種質(zhì)資源的創(chuàng)新與利用,是當前和未來作物遺傳改良最重要的內(nèi)容。”論文第一作者、廣東省農(nóng)業(yè)科學院作物研究所花生研究室主任魯清說,2019年,研究團隊正式啟動花生大規(guī)模種質(zhì)資源的全基因組重測序項目。EWM即熱新聞——關注每天科技社會生活新變化gihot.com

研究團隊篩選出390份代表性的核心花生種質(zhì),對其進行重測序,構建了一張包含880萬個單核苷酸多態(tài)性的花生全基因組變異圖譜。研究人員對28個重要農(nóng)藝性狀進行了全基因組關聯(lián)分析,獲得了上萬個顯著性關聯(lián)位點。通過候選基因分析,研究人員挖掘到調(diào)控花生株型和含油量的新基因,為分子育種提供優(yōu)異基因資源。EWM即熱新聞——關注每天科技社會生活新變化gihot.com

“含油量相關新基因的挖掘是花生研究的重要方向。找到調(diào)控花生含油量的關鍵基因,就找到了培育高產(chǎn)高油新品種的‘鑰匙’。”魯清介紹,從全基因組層面、從數(shù)百萬個變異位點中進行大規(guī)模樣本的綜合解析,這在該研究領域尚屬首次。EWM即熱新聞——關注每天科技社會生活新變化gihot.com

起源于南美洲的花生是如何引進我國并廣泛傳播的呢?“我們通過系統(tǒng)發(fā)育和種群結構分析,初步證實了我國花生引入后,分別形成了以華北和珠江流域為核心區(qū)域的兩大栽培中心,且兩個主要花生產(chǎn)區(qū)在長期育種過程中頻繁進行基因交換,形成了我國豐富的花生基因資源庫。”研究團隊首席科學家梁炫強介紹,研究表明,我國北方地區(qū)花生類群的基因流主要來自北美,而中國南方的花生則是從南亞和東南亞遷移而來,這也初步印證了多個農(nóng)史資料的結論。EWM即熱新聞——關注每天科技社會生活新變化gihot.com

此外,研究團隊還通過對南方產(chǎn)區(qū)經(jīng)典系譜11個品種測序,鑒定到2064個在育種中保留的核心基因模塊,解析了我國南方花生遺傳改良的分子遺傳機制。EWM即熱新聞——關注每天科技社會生活新變化gihot.com

“該研究提出了深入理解花生遺傳多樣性和傳播演化進程的重要線索,為全球花生的遺傳改良和育種策略的優(yōu)化提供了重要的遺傳資源。”研究團隊學科帶頭人陳小平透露,下一步將開展花生泛基因組研究,挖掘新的基因資源。同時,基于獲得的基因組關鍵結果,開發(fā)花生高效的分子育種技術體系,建立花生基因/基因組設計育種,實現(xiàn)從基因組的理論突破到遺傳育種的實際應用。 EWM即熱新聞——關注每天科技社會生活新變化gihot.com

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