廣告記者4月9日從中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院獲悉，全球首個榕屬植物對葉榕端粒到端粒完整基因組發(fā)布，修正了原有基因組中存在的多個間隙和組裝錯誤，大幅提升了對葉榕基因組的連續(xù)性、完整性和準(zhǔn)確性。相關(guān)研究成果日前發(fā)表在國際期刊《園藝研究》上。
榕樹是?？崎艑?00多種植物的統(tǒng)稱，廣泛分布于熱帶和亞熱帶地區(qū)，榕屬植物包含6個亞屬，其中對葉榕屬于聚果榕亞屬，是典型的功能雌雄異株植物。然而，對葉榕原有基因組中存在大量的信息缺失和組裝錯誤，阻礙了科研人員的進(jìn)一步研究。
論文通訊作者、中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院深圳農(nóng)業(yè)基因組研究所研究員張興坦告訴記者，該所農(nóng)業(yè)基因組學(xué)技術(shù)研發(fā)與應(yīng)用創(chuàng)新團(tuán)隊綜合利用多種測序技術(shù)，在原有基因組基礎(chǔ)上重新組裝、完善，發(fā)布了首個榕屬植物對葉榕端粒到端粒完整基因組。該基因組大小為371.8兆，所有序列均掛載到14條染色體上，并準(zhǔn)確解析了26642個編碼蛋白基因。經(jīng)評估，該基因組完整度達(dá)98.7%，大幅提升了對葉榕基因組的連續(xù)性和準(zhǔn)確性。
在此基礎(chǔ)上，研究人員進(jìn)一步構(gòu)建了對葉榕雄性和雌性花不同發(fā)育時期的基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)，并鑒定得到了雄花發(fā)育的關(guān)鍵基因，為研究榕屬植物重要特征和性別決定提供了重要資源。
“通過這項研究，我們不僅能更深入地理解榕樹的性別演變和關(guān)鍵生物學(xué)特性，還成功發(fā)現(xiàn)了可能的性別決定基因。同時，此次研究通過基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)，揭示了這些基因調(diào)控榕樹的性別表達(dá)和花發(fā)育過程，為植物性別決定機制和發(fā)育生物學(xué)提供了新的理論基礎(chǔ)。”論文第一作者、中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院深圳農(nóng)業(yè)基因組研究所博士后廖振陽表示。
記者4月9日從中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院獲悉，全球首個榕屬植物對葉榕端粒到端粒完整基因組發(fā)布，修正了原有基因組中存在的多個間隙和組裝錯誤，大幅提升了對葉榕基因組的連續(xù)性、完整性和準(zhǔn)確性。相關(guān)研究成果日前發(fā)表在國際期刊《園藝研究》上。
榕樹是桑科榕屬800多種植物的統(tǒng)稱，廣泛分布于熱帶和亞熱帶地區(qū)，榕屬植物包含6個亞屬，其中對葉榕屬于聚果榕亞屬，是典型的功能雌雄異株植物。然而，對葉榕原有基因組中存在大量的信息缺失和組裝錯誤，阻礙了科研人員的進(jìn)一步研究。
論文通訊作者、中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院深圳農(nóng)業(yè)基因組研究所研究員張興坦告訴記者，該所農(nóng)業(yè)基因組學(xué)技術(shù)研發(fā)與應(yīng)用創(chuàng)新團(tuán)隊綜合利用多種測序技術(shù)，在原有基因組基礎(chǔ)上重新組裝、完善，發(fā)布了首個榕屬植物對葉榕端粒到端粒完整基因組。該基因組大小為371.8兆，所有序列均掛載到14條染色體上，并準(zhǔn)確解析了26642個編碼蛋白基因。經(jīng)評估，該基因組完整度達(dá)98.7%，大幅提升了對葉榕基因組的連續(xù)性和準(zhǔn)確性。
在此基礎(chǔ)上，研究人員進(jìn)一步構(gòu)建了對葉榕雄性和雌性花不同發(fā)育時期的基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)，并鑒定得到了雄花發(fā)育的關(guān)鍵基因，為研究榕屬植物重要特征和性別決定提供了重要資源。
“通過這項研究，我們不僅能更深入地理解榕樹的性別演變和關(guān)鍵生物學(xué)特性，還成功發(fā)現(xiàn)了可能的性別決定基因。同時，此次研究通過基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)，揭示了這些基因調(diào)控榕樹的性別表達(dá)和花發(fā)育過程，為植物性別決定機制和發(fā)育生物學(xué)提供了新的理論基礎(chǔ)。”論文第一作者、中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院深圳農(nóng)業(yè)基因組研究所博士后廖振陽表示。
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