“不用最昂貴的鏡頭，也能拍出高清照片。”近年來，面對人們快速增加的影像清晰度需求，眾多手機、數(shù)碼相機廠商不斷探索如何在控制成本的情況下，使用AI模型進一步提升像素級。這一次，同樣的技術(shù)理念，卻被復(fù)旦大學(xué)計算機科學(xué)技術(shù)學(xué)院教授顏波帶領(lǐng)的團隊遷移到了生命科學(xué)實驗室里的常用研究工具“熒光顯微鏡”上。
4月12日，科學(xué)期刊《自然-方法》刊發(fā)團隊成果，他們發(fā)明的跨任務(wù)、多維度圖像增強基礎(chǔ)AI模型，實現(xiàn)了對現(xiàn)有熒光顯微成像極限的突破。
研究成果刊發(fā)。復(fù)旦大學(xué)供圖
何為熒光顯微鏡？這類顯微鏡利用部分物質(zhì)受紫外線照射后可發(fā)熒光的特性，以及通過染色讓本不具有該特性的物質(zhì)發(fā)出熒光，可以觀察細胞內(nèi)物質(zhì)的吸收、運輸、化學(xué)物質(zhì)的分布及定位等。在分辨率方面，它遠超普通光學(xué)顯微鏡0.2微米極限，到達觀測分子的納米尺度，是生命科學(xué)領(lǐng)域不可或缺的研究工具。
盡管熒光顯微鏡的觀測分辨率已達到納米尺度，但科學(xué)家們并不滿足于此。過去幾年中，生命科學(xué)和計算機領(lǐng)域的科學(xué)家們開始攜手探索用AI的路徑來增強圖像質(zhì)量的辦法。然而，成像模式多樣、降質(zhì)類型復(fù)雜、增強過程迥異等一系列問題，使得這一任務(wù)極具挑戰(zhàn)性，于是，大多數(shù)科學(xué)家選擇“每次解決一個問題”，聚焦于研制針對單一需求的“專有”AI模型。
來自復(fù)旦大學(xué)的這支AI for Science團隊則選擇直擊挑戰(zhàn)，以“一站式集成”為目標(biāo)，直接構(gòu)建了首個“統(tǒng)一”的熒光顯微鏡圖像增強AI基礎(chǔ)模型（UniFMIR），大幅提升在“圖像超分辨率重構(gòu)、各向同性重構(gòu)、3D去噪、圖像投影和過程重建”五大任務(wù)方向上的性能。
通過收集的大規(guī)模數(shù)據(jù)集對模型進行預(yù)訓(xùn)練，并使用不同圖像增強任務(wù)的數(shù)據(jù)微調(diào)模型參數(shù)，UniFMIR展現(xiàn)出比專有模型更好的增強性能和泛化性。
這意味著，加載了UniFMIR的熒光顯微鏡可能成為生命科學(xué)實驗室中的“神器”?？茖W(xué)家們能更清晰地觀察到活細胞內(nèi)部的微小結(jié)構(gòu)和復(fù)雜過程，加速全球生命科學(xué)、醫(yī)學(xué)研究、疾病診斷相關(guān)領(lǐng)域的科學(xué)發(fā)現(xiàn)和醫(yī)療創(chuàng)新；同時，在半導(dǎo)體制造、新材料研發(fā)等領(lǐng)域，該成果可以用來提升觀察和分析材料微觀結(jié)構(gòu)的質(zhì)量，從而優(yōu)化制造工藝和提高產(chǎn)品質(zhì)量。
UniFMIR的成功研發(fā)標(biāo)志著我國在關(guān)鍵科學(xué)儀器領(lǐng)域“國產(chǎn)設(shè)備+基礎(chǔ)模型”的組合能有效減少對進口設(shè)備的依賴，也為全球科研領(lǐng)域的進步貢獻了中國智慧和力量。
復(fù)旦大學(xué)計算機科學(xué)技術(shù)學(xué)院數(shù)字媒體實驗室成員。復(fù)旦大學(xué)供圖
“這次我們想到把AI圖像增強技術(shù)應(yīng)用于熒光顯微鏡上，并構(gòu)建UniFMIR，出發(fā)點就是AI for Science。我們的模型為熒光顯微鏡圖像增強提供了一個通用的解決方案，通過簡單的參數(shù)微調(diào)便可應(yīng)用于不同任務(wù)、成像模式和生物結(jié)構(gòu)。未來，生命科學(xué)實驗室的科學(xué)家們可通過進一步擴展訓(xùn)練數(shù)據(jù)的數(shù)據(jù)量和豐富度來不斷強化UniFMIR的圖像重構(gòu)能力。”顏波對UniFMIR被用于更多類型實驗的可能性充滿信心。
“不用最昂貴的鏡頭，也能拍出高清照片。”近年來，面對人們快速增加的影像清晰度需求，眾多手機、數(shù)碼相機廠商不斷探索如何在控制成本的情況下，使用AI模型進一步提升像素級。這一次，同樣的技術(shù)理念，卻被復(fù)旦大學(xué)計算機科學(xué)技術(shù)學(xué)院教授顏波帶領(lǐng)的團隊遷移到了生命科學(xué)實驗室里的常用研究工具“熒光顯微鏡”上。
4月12日，科學(xué)期刊《自然-方法》刊發(fā)團隊成果，他們發(fā)明的跨任務(wù)、多維度圖像增強基礎(chǔ)AI模型，實現(xiàn)了對現(xiàn)有熒光顯微成像極限的突破。
研究成果刊發(fā)。復(fù)旦大學(xué)供圖
何為熒光顯微鏡？這類顯微鏡利用部分物質(zhì)受紫外線照射后可發(fā)熒光的特性，以及通過染色讓本不具有該特性的物質(zhì)發(fā)出熒光，可以觀察細胞內(nèi)物質(zhì)的吸收、運輸、化學(xué)物質(zhì)的分布及定位等。在分辨率方面，它遠超普通光學(xué)顯微鏡0.2微米極限，到達觀測分子的納米尺度，是生命科學(xué)領(lǐng)域不可或缺的研究工具。
盡管熒光顯微鏡的觀測分辨率已達到納米尺度，但科學(xué)家們并不滿足于此。過去幾年中，生命科學(xué)和計算機領(lǐng)域的科學(xué)家們開始攜手探索用AI的路徑來增強圖像質(zhì)量的辦法。然而，成像模式多樣、降質(zhì)類型復(fù)雜、增強過程迥異等一系列問題，使得這一任務(wù)極具挑戰(zhàn)性，于是，大多數(shù)科學(xué)家選擇“每次解決一個問題”，聚焦于研制針對單一需求的“專有”AI模型。
來自復(fù)旦大學(xué)的這支AI for Science團隊則選擇直擊挑戰(zhàn)，以“一站式集成”為目標(biāo)，直接構(gòu)建了首個“統(tǒng)一”的熒光顯微鏡圖像增強AI基礎(chǔ)模型（UniFMIR），大幅提升在“圖像超分辨率重構(gòu)、各向同性重構(gòu)、3D去噪、圖像投影和過程重建”五大任務(wù)方向上的性能。
通過收集的大規(guī)模數(shù)據(jù)集對模型進行預(yù)訓(xùn)練，并使用不同圖像增強任務(wù)的數(shù)據(jù)微調(diào)模型參數(shù)，UniFMIR展現(xiàn)出比專有模型更好的增強性能和泛化性。
這意味著，加載了UniFMIR的熒光顯微鏡可能成為生命科學(xué)實驗室中的“神器”?？茖W(xué)家們能更清晰地觀察到活細胞內(nèi)部的微小結(jié)構(gòu)和復(fù)雜過程，加速全球生命科學(xué)、醫(yī)學(xué)研究、疾病診斷相關(guān)領(lǐng)域的科學(xué)發(fā)現(xiàn)和醫(yī)療創(chuàng)新；同時，在半導(dǎo)體制造、新材料研發(fā)等領(lǐng)域，該成果可以用來提升觀察和分析材料微觀結(jié)構(gòu)的質(zhì)量，從而優(yōu)化制造工藝和提高產(chǎn)品質(zhì)量。
UniFMIR的成功研發(fā)標(biāo)志著我國在關(guān)鍵科學(xué)儀器領(lǐng)域“國產(chǎn)設(shè)備+基礎(chǔ)模型”的組合能有效減少對進口設(shè)備的依賴，也為全球科研領(lǐng)域的進步貢獻了中國智慧和力量。
復(fù)旦大學(xué)計算機科學(xué)技術(shù)學(xué)院數(shù)字媒體實驗室成員。復(fù)旦大學(xué)供圖
“這次我們想到把AI圖像增強技術(shù)應(yīng)用于熒光顯微鏡上，并構(gòu)建UniFMIR，出發(fā)點就是AI for Science。我們的模型為熒光顯微鏡圖像增強提供了一個通用的解決方案，通過簡單的參數(shù)微調(diào)便可應(yīng)用于不同任務(wù)、成像模式和生物結(jié)構(gòu)。未來，生命科學(xué)實驗室的科學(xué)家們可通過進一步擴展訓(xùn)練數(shù)據(jù)的數(shù)據(jù)量和豐富度來不斷強化UniFMIR的圖像重構(gòu)能力。”顏波對UniFMIR被用于更多類型實驗的可能性充滿信心。
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