廣告5月19日，重慶市農(nóng)科院發(fā)布消息，該院果樹所柑橘創(chuàng)新團隊楊蕾、洪林、王敏、李霜等研究人員發(fā)布了國際首個血橙高質(zhì)量基因組。相關研究成果以學術論文近日在國際期刊《科學數(shù)據(jù)》發(fā)表。
楊蕾介紹，血橙是一種極具特色的甜橙品種，具有較高的花青素含量，其含有的多種成分對人體健康有益。目前，國內(nèi)血橙主要在川渝地區(qū)種植，總種植面積超過100萬畝，其中重慶有40萬余畝。然而，現(xiàn)主栽血橙品種存在品質(zhì)不穩(wěn)定等問題。
該團隊開展自主品種選育，發(fā)掘高糖高花青素芽變新資源“內(nèi)秀”，其花青素含量更高，血色更深，糖度也更高。由于國際上尚未有公開發(fā)布的高質(zhì)量的血橙基因組，團隊利用最新的第三代測序技術，對血橙芽變資源進行了全基因組測序，成功組裝了首個血橙高質(zhì)量基因組，測序深度可達65X，基因組裝完整度評估為98.20%。團隊結合比較基因組學分析，揭示了血橙花青素合成能力的染色體結構變異基礎。
檢測分析表明，在中國西南地區(qū)，“內(nèi)秀”在甜度和紅度方面都超過了當?shù)刂髁髌贩N“塔羅科”血橙，具有強大的市場潛力。此項科技成果將有力推動高品質(zhì)血橙功能基因研究和基因組進化研究工作，并為后續(xù)血橙特異基因挖掘和育種利用提供核心素材。
5月19日，重慶市農(nóng)科院發(fā)布消息，該院果樹所柑橘創(chuàng)新團隊楊蕾、洪林、王敏、李霜等研究人員發(fā)布了國際首個血橙高質(zhì)量基因組。相關研究成果以學術論文近日在國際期刊《科學數(shù)據(jù)》發(fā)表。
楊蕾介紹，血橙是一種極具特色的甜橙品種，具有較高的花青素含量，其含有的多種成分對人體健康有益。目前，國內(nèi)血橙主要在川渝地區(qū)種植，總種植面積超過100萬畝，其中重慶有40萬余畝。然而，現(xiàn)主栽血橙品種存在品質(zhì)不穩(wěn)定等問題。
該團隊開展自主品種選育，發(fā)掘高糖高花青素芽變新資源“內(nèi)秀”，其花青素含量更高，血色更深，糖度也更高。由于國際上尚未有公開發(fā)布的高質(zhì)量的血橙基因組，團隊利用最新的第三代測序技術，對血橙芽變資源進行了全基因組測序，成功組裝了首個血橙高質(zhì)量基因組，測序深度可達65X，基因組裝完整度評估為98.20%。團隊結合比較基因組學分析，揭示了血橙花青素合成能力的染色體結構變異基礎。
檢測分析表明，在中國西南地區(qū)，“內(nèi)秀”在甜度和紅度方面都超過了當?shù)刂髁髌贩N“塔羅科”血橙，具有強大的市場潛力。此項科技成果將有力推動高品質(zhì)血橙功能基因研究和基因組進化研究工作，并為后續(xù)血橙特異基因挖掘和育種利用提供核心素材。
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