瑞典哥德堡大學(xué)團(tuán)隊(duì)開發(fā)了一種人工智能(AI)模型,通過糖分析增加檢測癌癥的可能性。與當(dāng)前的半手動(dòng)方法相比,AI模型能在幾秒鐘內(nèi)準(zhǔn)確發(fā)現(xiàn)異常。研究結(jié)果發(fā)表在新一期《自然·方法學(xué)》雜志上。
聚糖或糖分子的結(jié)構(gòu)普遍存在于人體細(xì)胞中,可通過質(zhì)譜儀測量。這些結(jié)構(gòu)的一個(gè)重要的用途就是可指示細(xì)胞中不同形式的癌癥。然而,從質(zhì)譜儀測量的數(shù)據(jù)必須由人來仔細(xì)分析,這一過程可能需要數(shù)小時(shí)至數(shù)天,且只能由少數(shù)專家進(jìn)行。因此,當(dāng)有大量樣品需要分析時(shí),這一漫長過程就成為甘聚糖分析法的一個(gè)瓶頸。 鑒于此,研究團(tuán)隊(duì)開發(fā)了一個(gè)AI模型“Candycrunch”來自動(dòng)完成這項(xiàng)篩查工作。該AI模型每次測試只需幾秒鐘即可完成。團(tuán)隊(duì)使用超過50萬個(gè)不同的片段和糖分子相關(guān)結(jié)構(gòu)的數(shù)據(jù)庫,對AI模型進(jìn)行了訓(xùn)練。這種訓(xùn)練使“Candycrunch”能在90%的案例中,極其快速準(zhǔn)確地計(jì)算出樣本中糖的精確結(jié)構(gòu)。“Candycrunch”也能識別由于低濃度而經(jīng)常被人類分析遺漏的結(jié)構(gòu)。因此,該模型可幫助科學(xué)家找到新的基于聚糖的生物標(biāo)志物。
研究團(tuán)隊(duì)認(rèn)為,利用AI模型檢測癌癥,很快可達(dá)到與其他生物序列(如DNA、RNA或蛋白質(zhì))測序相同的精度水平。
除此之外,由于AI模型的“答案”如此快速和準(zhǔn)確,不僅可加速糖基生物標(biāo)志物的發(fā)現(xiàn),還可應(yīng)用于癌癥的診斷和預(yù)后。研究團(tuán)隊(duì)相信,甘聚糖分析將成為生物學(xué)和臨床研究中一個(gè)更大的組成部分。
瑞典哥德堡大學(xué)團(tuán)隊(duì)開發(fā)了一種人工智能(AI)模型,通過糖分析增加檢測癌癥的可能性。與當(dāng)前的半手動(dòng)方法相比,AI模型能在幾秒鐘內(nèi)準(zhǔn)確發(fā)現(xiàn)異常。研究結(jié)果發(fā)表在新一期《自然·方法學(xué)》雜志上。
聚糖或糖分子的結(jié)構(gòu)普遍存在于人體細(xì)胞中,可通過質(zhì)譜儀測量。這些結(jié)構(gòu)的一個(gè)重要的用途就是可指示細(xì)胞中不同形式的癌癥。然而,從質(zhì)譜儀測量的數(shù)據(jù)必須由人來仔細(xì)分析,這一過程可能需要數(shù)小時(shí)至數(shù)天,且只能由少數(shù)專家進(jìn)行。因此,當(dāng)有大量樣品需要分析時(shí),這一漫長過程就成為甘聚糖分析法的一個(gè)瓶頸。 鑒于此,研究團(tuán)隊(duì)開發(fā)了一個(gè)AI模型“Candycrunch”來自動(dòng)完成這項(xiàng)篩查工作。該AI模型每次測試只需幾秒鐘即可完成。團(tuán)隊(duì)使用超過50萬個(gè)不同的片段和糖分子相關(guān)結(jié)構(gòu)的數(shù)據(jù)庫,對AI模型進(jìn)行了訓(xùn)練。這種訓(xùn)練使“Candycrunch”能在90%的案例中,極其快速準(zhǔn)確地計(jì)算出樣本中糖的精確結(jié)構(gòu)。“Candycrunch”也能識別由于低濃度而經(jīng)常被人類分析遺漏的結(jié)構(gòu)。因此,該模型可幫助科學(xué)家找到新的基于聚糖的生物標(biāo)志物。
研究團(tuán)隊(duì)認(rèn)為,利用AI模型檢測癌癥,很快可達(dá)到與其他生物序列(如DNA、RNA或蛋白質(zhì))測序相同的精度水平。
除此之外,由于AI模型的“答案”如此快速和準(zhǔn)確,不僅可加速糖基生物標(biāo)志物的發(fā)現(xiàn),還可應(yīng)用于癌癥的診斷和預(yù)后。研究團(tuán)隊(duì)相信,甘聚糖分析將成為生物學(xué)和臨床研究中一個(gè)更大的組成部分。
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