廣告1月29日，記者從華南農(nóng)業(yè)大學(xué)獲悉，該校豬禽種業(yè)全國重點實驗室教授張哲、李加琪團隊與國內(nèi)外多個團隊合作，在豬基因組學(xué)領(lǐng)域取得重要進展。科研人員研究整理出迄今最大規(guī)模的豬轉(zhuǎn)錄組大數(shù)據(jù)集，構(gòu)建了多組織遺傳調(diào)控效應(yīng)圖譜，為完善豬基因組功能注釋提供了極為豐富的數(shù)據(jù)資源。相關(guān)研究成果近日在線發(fā)表于《自然·遺傳學(xué)》。
我國是豬肉生產(chǎn)和消費第一大國。“鑒定豬的重要經(jīng)濟性狀的育種靶點，解析其遺傳調(diào)控機制，研發(fā)配套技術(shù)，并把技術(shù)創(chuàng)新運用到實際育種，培育突破性中國特色新品種，是打好種業(yè)翻身仗的關(guān)鍵。”張哲介紹，他們從公共數(shù)據(jù)庫中收集了全球100多個豬品種的所有轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)和其他多組學(xué)數(shù)據(jù)，涵蓋了138種組織或細胞類型，獲得了5種轉(zhuǎn)錄本的2292954個分子表型。
在此基礎(chǔ)上，研究團隊深入解析了豬多組織基因表達模式，鑒定出34個代表性組織的特異表達基因。同時，該研究通過開展大規(guī)模分子數(shù)量性狀基因座（QTL）定位，發(fā)布了迄今最大規(guī)模的豬多組織遺傳調(diào)控效應(yīng)圖譜，并通過整合多組學(xué)信息，深入探討了遺傳調(diào)控變異的特性和分子機制。
據(jù)介紹，研究團隊通過整合遺傳調(diào)控效應(yīng)圖譜，全面系統(tǒng)地解析了豬復(fù)雜性狀遺傳調(diào)控機制。研究人員利用多種統(tǒng)計分析方法，將圖譜與268個豬復(fù)雜性狀全基因組關(guān)聯(lián)研究（GWAS）的統(tǒng)計量結(jié)果進行整合挖掘，揭示了多組織分子QTL對豬復(fù)雜性狀遺傳機制解析具有重要作用。此外，研究團隊還解析了其中80%的GWAS信號與多組織分子表型的潛在遺傳關(guān)聯(lián)，為豬復(fù)雜性狀遺傳機制的精準解析提供了分析流程范例。
為深入發(fā)掘豬作為生物醫(yī)學(xué)模型的潛力，研究團隊通過遺傳調(diào)控水平的物種間比較分析，揭示了豬和人類基因組中共享的遺傳調(diào)控效應(yīng)。研究團隊發(fā)現(xiàn)了89個顯著相關(guān)的人類—豬性狀組合，表明了豬和人類在復(fù)雜性狀中具有相似的遺傳調(diào)控效應(yīng)。
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為深入發(fā)掘豬作為生物醫(yī)學(xué)模型的潛力，研究團隊通過遺傳調(diào)控水平的物種間比較分析，揭示了豬和人類基因組中共享的遺傳調(diào)控效應(yīng)。研究團隊發(fā)現(xiàn)了89個顯著相關(guān)的人類—豬性狀組合，表明了豬和人類在復(fù)雜性狀中具有相似的遺傳調(diào)控效應(yīng)。
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