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　　地球上所有生物的最后一個(gè)共同祖先是一種生活在42億年前的微生物，其基因組相當(dāng)龐大，編碼了約2600種蛋白質(zhì)。它以氫氣和二氧化碳為食，并擁有抵御病毒入侵的基本免疫系統(tǒng)。HVb即熱新聞——關(guān)注每天科技社會(huì)生活新變化gihot.com
　　這是7月12日發(fā)表于《自然-生態(tài)與進(jìn)化》的一項(xiàng)新研究的結(jié)論。該研究比較了700種現(xiàn)代微生物的基因組，以尋找共性，確定哪些特征是最先出現(xiàn)的。盡管該研究沒有揭示生命是如何開始的，但它表明，在地球形成幾億年后，一種與現(xiàn)代微生物相似的復(fù)雜細(xì)胞生物進(jìn)化出來了。HVb即熱新聞——關(guān)注每天科技社會(huì)生活新變化gihot.com
　　“我非常興奮。”美國(guó)威斯康星大學(xué)麥迪遜分校進(jìn)化生物學(xué)家Betl Kacar說，“這是一個(gè)全面的分析，也是一個(gè)很好的例子。”HVb即熱新聞——關(guān)注每天科技社會(huì)生活新變化gihot.com
　　這并不是科學(xué)家第一次試圖勾勒出所有物種在分化之前的最后一個(gè)共同祖先(LUCA)。例如，2016年，由德國(guó)杜塞爾多夫大學(xué)進(jìn)化生物學(xué)家William Martin領(lǐng)導(dǎo)的研究比較了已知微生物基因組，提供了迄今最令人信服的遺傳證據(jù)，表明LUCA可能是一種厭氧菌。Martin的基因分析還發(fā)現(xiàn)了證據(jù)，表明它是一種以氫氣為食的嗜熱微生物，可能生活在海底火山口附近。HVb即熱新聞——關(guān)注每天科技社會(huì)生活新變化gihot.com
　　Martin團(tuán)隊(duì)在2016年的研究中沒有給出LUCA的具體時(shí)間，但其他研究將LUCA的存在時(shí)間定位在38億年前。在新的研究中，英國(guó)布里斯托大學(xué)基因組學(xué)專家Edmund Moody開發(fā)了一種能更精確預(yù)測(cè)LUCA存在時(shí)間的方法。HVb即熱新聞——關(guān)注每天科技社會(huì)生活新變化gihot.com
　　利用微生物物種中不同但已知的基因突變率，以及物種間基因轉(zhuǎn)移的速度，能夠創(chuàng)建一種分子鐘。通過構(gòu)建家譜，找出哪些生物可能是從其他生物進(jìn)化而來的，并追蹤保守基因的遺傳變化，研究人員可以大致估計(jì)出兩個(gè)相鄰分支的分化時(shí)間，從而確定它們共同祖先的“年齡”。HVb即熱新聞——關(guān)注每天科技社會(huì)生活新變化gihot.com
　　Moody和同事進(jìn)一步研究了在多種細(xì)菌和古細(xì)菌中發(fā)現(xiàn)的5組“平行”或重復(fù)的基因，它們意味著，在LUCA分裂出這些后代之前，基因倍增就發(fā)生了。Moody說，追蹤一個(gè)突變是發(fā)生在這些基因的兩個(gè)拷貝上，還是只發(fā)生在一個(gè)拷貝上，可以更容易確定它們復(fù)制的時(shí)間，從而確定LUCA的“年齡”。HVb即熱新聞——關(guān)注每天科技社會(huì)生活新變化gihot.com
　　他們的分析表明，LUCA生活在大約42億年前。沒有參與這項(xiàng)研究的美國(guó)卡爾頓學(xué)院進(jìn)化微生物學(xué)家Rika Anderson說：“這可能比其他的估計(jì)要早一點(diǎn)，但相差不大。”HVb即熱新聞——關(guān)注每天科技社會(huì)生活新變化gihot.com
　　為了像Martin一樣探索LUCA的生活方式，Moody研究小組追蹤了350種細(xì)菌和350種古細(xì)菌的57個(gè)“標(biāo)記”基因，以構(gòu)建一棵生命樹。Moody團(tuán)隊(duì)分別追蹤了這些細(xì)菌和古生菌的個(gè)體基因和基因家族的進(jìn)化模式，這些基因被編目在一個(gè)常用的基因組數(shù)據(jù)庫(kù)中。通過比較的個(gè)體基因與物種基因的進(jìn)化史，他們可以更好地確定哪些基因被復(fù)制、丟失或經(jīng)歷了水平基因轉(zhuǎn)移。由此，他們可以推斷出LUCA中存在的物質(zhì)。HVb即熱新聞——關(guān)注每天科技社會(huì)生活新變化gihot.com
　　英國(guó)科學(xué)家的分析表明，LUCA以二氧化碳和氫氣為“燃料”。但他們還發(fā)現(xiàn)證據(jù)，表明LUCA有一種基因可以保護(hù)它免受紫外線的傷害，意味著這種微生物可能生活在地表水中——在那里它可以從大氣中捕獲二氧化碳和氫氣，而不是生活在深?；鹕娇?。但同Martin一樣，他們發(fā)現(xiàn)了一種被稱為逆轉(zhuǎn)錄酶的酶的特征，這種酶通常存在于嗜熱菌中，他們承認(rèn)這意味著LUCA也可能在火山口周圍繁殖。HVb即熱新聞——關(guān)注每天科技社會(huì)生活新變化gihot.com
　　Moody還發(fā)現(xiàn)，LUCA可能有19個(gè)CRISPR-Cas9基因，這是現(xiàn)代細(xì)菌用來切割入侵病毒遺傳物質(zhì)的裝置。這讓Kacar興奮不已，因?yàn)樗凳玖撕芫靡郧按嬖诘囊粋€(gè)由微生物和病原體組成的繁榮生態(tài)系統(tǒng)。Anderson指出，CRISPR-Cas9系統(tǒng)“有點(diǎn)復(fù)雜”。這意味著在短短數(shù)億年內(nèi)，地球早期生命就進(jìn)化出了復(fù)雜的微生物，這些微生物相互作用，迅速形成了一個(gè)簡(jiǎn)單的生態(tài)系統(tǒng)。